Τα Π.Δ.Σ. προσδίδουν στο Τμήμα που τα οργανώνει, αλλά και στο Πανεπιστήμιο κύρος και αναγνώριση καθώς συμβάλλουν στην διεύρυνση της ερευνητικής παραγωγής με στόχο τη δημοσίευση των επιστημονικών ευρημάτων που παράγονται κατά τη διάρκειά τους. Σύμφωνα με το άρθρο 91 του Ν. 4957/2022, με απόφαση της Συνέλευσης του εκάστοτε Τμήματος καταρτίζεται ο Κανονισμός Διδακτορικών Σπουδών του Τμήματος, ο οποίος εγκρίνεται από τη Σύγκλητο, δημοσιεύεται στην Εφημερίδα της Κυβερνήσεως, αναρτάται στον διαδικτυακό τόπο του Τμήματος και κοινοποιείται στο Υπουργείο Παιδείας και Θρησκευμάτων.

Η Συνέλευση κάθε Τμήματος ορίζει τον αριθμό των υποψηφίων διδακτόρων/ρισσών που δύναται να επιβλέψει ένα μέλος Δ.Ε.Π., λαμβάνοντας υπόψη τις ανάγκες του επιστημονικού πεδίου, τον αριθμό μελών Δ.Ε.Π. α ́ βαθμίδας, Αναπληρωτή/τριας και Επίκουρου καθηγητή/τριας του Τμήματος. Κάθε μέλος Δ.Ε.Π. δύναται να επιβλέψει συνολικά οκτώ (8) Δ.Δ., είτε με επίβλεψη, είτε με συνεπίβλεψη. Επιπλέον, σε ειδικές περιπτώσεις (πχ. ο/η επιβλέπων/ουσα εκλείψει), κατά τις οποίες το μέλος Δ.Ε.Π. καλείται να αναλάβει Δ.Δ. άλλου μέλους Δ.Ε.Π., τότε με απόφαση της Συνέλευσης ο αριθμός των Δ.Δ. που επιβλέπει μπορεί να μεταβληθεί. Επίσης, στην περίπτωση συνεπίβλεψης συντάσσεται Ειδικό Πρωτόκολλο Συνεργασίας.

Επιπλέον, τα Τμήματα δύνανται να επιλέξουν η εκπόνηση της Δ.Δ. να πραγματοποιείται με συλλογή άρθρων – τόμος (paper collection). Στην περίπτωση αυτή συστήνεται στο Τμήμα να ορίσει αυστηρότερες προϋποθέσεις στην εκπόνηση δημοσιεύσεων, συγκριτικά με τις οριζόμενες ως ελάχιστα απαιτούμενες στον Κανονισμό Διδακτορικών Σπουδών.